وقد تعرض في حياته إلى العديد من الصدمات كان أولها إعدام شقيقه الأصغر عام 1867م ماكسيميليان الذي كان امبراطوراً للمكسيك حينذاك، وأيضًا انتحر ابنه الأرشيدوق رودلف سنة 1889م، ثم وفاة شقيقه كارل لودفيغ ولي العهد في عام 1896م بعد مرض تعرض له بسبب شربه لمياه ملوثة خلال رحلته إلى الأراضي المقدسة. بعد وفاة شقيقه بسنتين قُتلت زوجته إليزابيث في جنيف على يد منشق إيطالي وبعد ذلك أصبحت عمليه وراثة العرش معقدة.

فلذلك برز ابن شقيقه المتوفي «كارل لودفيغ» وهو فرانز فرديناند الذي أصبح ولي العهد التالي، ولكن بسبب زواجه من صوفي شوتيك مرغنطي، منع أبنائهم من وراثة العرش، حضر زفاف القيصر الألماني فيلهلم الثاني والقيصر الروسي نيكولاس الثاني، ومع ذلك لم يحضر الإمبراطور فرانز يوزف حفلة زفافه في عام 1900م وأيضاً جنازته بعد أن اغتيل في سنة 1914م في سراييفو على يد طالب صربي متشدد وكان السبب الرئيسي لـ حرب العالمية الأولى، وبعد أن اشتعلت الحرب العالمية الأولى توفي الامبراطور في 21 نوفمبر 1916م بعد حكم لمدة 66 سنة وتولى بعده حفيد أخيه الأصغر كارل الأول (إمبراطور النمسا).

كان فرانز جوزيف منزعجًا من القومية طوال فترة حكمه. أنهى التسوية النمساوية المجرية لعام 1867م، والتي منحت استقلالًا أكبر من الحكم الذاتي للمجر وحولت الإمبراطورية النمساوية إلى الملكية المزدوجة للنمسا-المجر. حكم سلميًا لمدة 45 عامًا، لكنه عانى على الصعيد الشخصي من مآسي إعدام شقيقه، إمبراطور المكسيك ماكسيميليان عام 1867، وانتحار ابنه الوحيد وولي العهد الأمير رودولف، في عام 1889م، واغتيال زوجته، الإمبراطورة إليزابيث («السيسي»)، عام 1898، واغتيال ابن أخيه ووريثه المفترض، الأرشيدوق فرانز فرديناند، عام 1914م.

بعد الحرب النمساوية البروسية، وجهت النمسا-المجر اهتمامها إلى البلقان، والتي كانت نقطة ساخنة وحساسة للتوتر الدولي بسبب تضارب المصالح مع الإمبراطورية الروسية. كانت الأزمة البوسنية نتيجة لضم فرانز جوزيف للبوسنة والهرسك في عام 1908م، والتي احتلتها قواته منذ مؤتمر برلين (1878م).

في 28 يونيو 1914م، أدى اغتيال ابن أخيه ووريثه المفترض، الأرشيدوق فرانز فرديناند في سراييفو إلى إعلان النمسا والمجر الحرب ضد مملكة صربيا، التي كانت حليفة للإمبراطورية الروسية. أدى ذلك إلى نشاط نظام التحالفات ما أدى إلى اندلاع الحرب العالمية الأولى.

توفي فرانز جوزيف في 21 نوفمبر 1916م، بعد أن حكم لما يقرب 68 عامًا، ليموت واحدًا من أطول الملوك حكمًا في التاريخ الحديث. وخلفه ابن أخيه شارل الأول.!!!!!!!