بعد تخرجه من الثانوية عام 1920 سجل ويغنر في جامعة بودابست للعلوم التقنية؛ ولم تعجبه المقررات فيها، وفي عام 1921 سجل في جامعة برلين التقنية، حيث درس الهندسة الكيميائية؛ كما حضر أيضًا مؤتمرات يوم الأربعاء بعد الظهر للجمعية الفيزيائية الألمانية، وقد استضافت هذه المؤتمرات بعض اللامعين مثل ماكس بلانك وماكس فون لو ورودولف لادينبيرغ وويرنر هيزنبرغ ووالتر نيرنست وولفغانغ باولي وألبرت أينشتاين؛ كما التقى ويغنر مرة بالفيزيائي ليو سزيلارد الذي أصبح صديقه المقرب. وكان لتجربة ثالثة في برلين أثر بنّاء؛ حيث عمل ويغنر في معهد كايسر ويلهيلم للكيمياء الفيزيائية والكيمياء الكهربائية (معهد فريتز هابر الآن) وهناك التقى ميشيل بولانياي الذي أصبح بعد لاسزلو راتز معلم ويغنر الأعظم، وقد أشرف ميشيل على رسالة دكتوراه ويغنر «تشكل وتفكك الجزيئات».!!!